چشمان سگ هاسکی

چشمان سگ هاسکی

چشمان سگ هاسکی: بر اساس تحقیق منتشر شده در 4 اکتبر 2018 ، توسط “آدام بویکو” و “آرون سام” و همکارانش از شرکت دامپزشکی “امبارک” یک شرکت راه اندازی “دی ان ای “سگ در بوستون ، و شریک پژوهشی دامپزشکی کالج دانشگاه کرنل ، در مجله دسترسی آزاد “پلاس ژنتیک” ، آزمایش ها بر روی بیش از 6000 سگ، نشان می دهد که یک نسخه برداری از کروم سگ حدود 18 سال، به چشم های آبی سگ سیبری شباهت دارد.چشمان سگ هاسکی

اولین مطالعه ژنومیک

به گفته نویسندگان، این نشان دهنده اولین مطالعه ژنومیک استفاده شده در مدل غیر انسانی است و بزرگترین ژنوم سگ انجام شده به طور گسترده به عنوان مطالعه جامعه تا به امروز است. ژنومیک مصرف کننده، کشف ژنتیک را در مقیاس بی سابقه با اتصال پایگاه داده های بسیار بزرگ از داده های ژنوم با اطلاعات فنوتیپ به طور داوطلبانه از طریق بررسی های وب ارائه شده را قادر می سازد.

سگ سیبری

اما وعده اطلاعات ژنومی مصرف کننده محدود به تحقیقات انسانی نیست. ابزار ژنومی برای سگ ها به آسانی در دسترس است، اما پایه های ژنتیکی بسیاری از ویژگی های مهم هنوز کشف نشده اند. اگرچه دو ژنتیکی، در بعضی از سگ ها چشم آبی رنگ را مشخص می کنند اما در برخی از سگ ها مانند سگ سیبری )هاسکی( به این شکاف در دانش اطلاق نمی شود، “بویکو و سم” و همکارانش از پانل متنوع 6،070 سگ آزمایش شده ژنتیکی با صاحبانی که داده فنوتیپ را از طریق نظرسنجی های مبنی بر وب و بارگذاری عکس ها استفاده می کنند به اشتراک گذاشتند .چشمان سگ هاسکی

کروموزوم

آنها دریافتند که کپی برداری 98.6 کیلوباز بر روی کروموزوم 18 نزدیک ژن الکس 4 که نقش مهمی در توسعه چشم پستانداران دارد، به شدت با تغییرات رنگ چشم آبی شباهت داشت، عمدتا به سگ سیبری، و همچنین در استرالیایی شبیه نیست. یک کپی از این نوع به اندازه کافی برای ایجاد چشم آبی یا هتروکرومای )چشم آبی و قهوه ای( بود، گرچه بعضی از این نوع سگ ها چشم آبی ندارند، بنابراین دیگر عوامل ژنتیکی یا محیطی هنوز درگیر هستند .

مطالعات

مطالعات آینده مکانیسم عملکردی که این ارتباط را ایجاد میکند می تواند منجر به کشف یک راه جدیدی شود که چشم های آبی آن در پستانداران ایجاد می شود. از دیدگاه وسیع تر، نتایج تأکید بر کشف داده های مصرف کننده در گونه های غیر انسانی، به خصوص سگ ها، جایی که علاقه شدید مالک به اطلاعات ژنتیکی حیوانات خانگی آنها وجود دارد، سطح بالایی از تعامل با نظرسنجی های مبتنی بر وب ، و یک معماری ژنتیک پایه ای ایده آل برای نقشه برداری مطالعات است.”

آرون سام افزود

با استفاده از اطلاعات ژنتیکی حیوانات خانگی مشتریان، همراه با رنگ چشم که توسط مشتریان برای آن حیوانات گزارش شده بود، ما یک نسخه برداری ژنتیکی را کشف کرده ایم که به شدت با رنگ چشم آبی ارتباط دارد. این مطالعه قدرت رویکردی که “امبارک” در جهت بهبود سلامت سگ ها بکار می گیرد را نشان می دهد.

تحقیقات مورفولوژیکی

در یک سال یکبار، اطلاعات کافی برای انجام بزرگترین تحقیقات مربوط به این نوع سگ را جمع آوری کردیم . ” امبارک” در حال حاضر پروژه های تحقیقاتی مشابه را در طیف وسیعی از ویژگی های مورفولوژیکی و بهداشتی دنبال می کند و امیدواریم همچنان از پلت فرم ما برای انتقال ژنتیک و سلامت سگ به روش بسیار واقعی استفاده کنیم . “

متن انگلیسی

Huskies eyes

DNA testing of more than 6,000 dogs has revealed that a duplication on canine chromo some 18 is strongly associated with blue eyes in Siberian Huskies, according to a study published October 4, 2018, in the open access journal PLOS Genetics by “Adam Boyko” and “Aaron Sams” of Embark Veterinary, Inc., and colleagues. Embark is a dog DNA startup company headquartered in Boston, MA, and Ithaca, NY, and research partner of the Cornell University College of Veterinary Medicine.

consumer genomics study

According to the authors, this represents the first consumer genomics study ever conducted in a non-human model and the largest canine genome wide as sociation study to date Consumer genomics enables genetic discovery on an unprecedented scale by linking very large databases of genomic data with phenotype information voluntarily submitted via web-based surveys.

[vip_data]

Siberian Huskies

But the promise of consumer genomic data is not limited to human research. Genomic tools for dogs are readily available but the genetic underpinnings of many important traits remain undiscovered. Although two genetic variants are known to underlie blue eye color in some dogs, these do not explain the trait in some other dogs, like Siberian Huskies to address this gap in knowledge, “Boyko, Sams” and colleagues used a diverse panel of 6,070 genetically tested dogs with owners that contributed phenotype data via web-based surveys and photo uploads.

chromosome

They found that a 98.6-kilobase duplication on chromosome 18 near the ALX4 gene, which plays an important role in mammalian eye development, was strongly associated with variation in blue eye color, primarily in Siberian Huskies but also in non-merle Australian Shepherds. One copy of the variant was enough to cause blue eyes or heterochromia (blue and brown eyes), although some dogs with the variant did not have blue eyes, so other genetic or environmental factors are still involved.

Studies

Future studies of the functional mechanism underlying this association may lead to the discovery of a novel pathway by which blue eyes develop in mammals. From a broader perspective, the results underscore the power of consumer data driven discovery in non-human species, especially dogs, where there is intense owner interest in the personal genomic information of their pets, a high level of engagement with web based surveys, and an underlying genetic architecture ideal for mapping studies.

Aaron Sam adds

“Aaron Sam” adds: “Using genetic data from the pets of our customers, combined with eye colors reported by customers for those same animals, we have discovered a genetic duplication that is strongly associated with blue eye color. This study demonstrates the power of the approach that Embark is taking towards improving canine health.

[/vip_data]

Morphological researches

In a single year, we collected enough data to conduct the largest canine study of its kind. Embark is currently pursuing similar research projects in a range of morphological and health related traits and we hope to continue to use our platform to move canine genetics and health forward in a very real way.”